Elementos regulatorios cis conservados en el promotor Dof01 de maíz: regulador clave de la respuesta a estrés por frío

Resumen

Los patrones de expresión de genes son controlados por elementos regulatorios cis (CRE) presentes en los promotores. Para entender cómo los CRE son responsables de la actividad transcripcional y forman la arquitectura de un promotor, es necesario identificarlos y asociarlos a respuestas específicas. Los estudios comparativos de promotores Dof se han enfocado en analizar estas secuencias en diferentes especies. Sin embargo, se desconoce cómo los CRE son conservados entre diferentes variedades de una misma especie. En este trabajo se realizó un análisis comparativo de las secuencias del promotor del gen Dof01 de cinco variedades de maíz (Zea mays) (B73, Palomero Toluqueño, Teosinte, W22 y Mo17) para entender la arquitectura del promotor Dof01. El análisis de secuencias mostró que hay un elemento de inserción/deleción de 179 pb que está presente en el promotor Dof01 de B73 pero ausente en las otras cuatro variedades. También, se identificaron CRE altamente conservados y que pueden estar relacionados con la respuesta a bajas temperaturas. Por eso, se analizó la expresión del gen Dof01 en B73 y Palomero bajo condiciones de estrés por baja (4°C) y alta (42°C) temperatura. Los datos de expresión mostraron que el gen Dof01 de Palomero se sobre expresa con respecto al control debido a la respuesta a frío. Este trabajo es el primer paso para la caracterización funcional del promotor del gen Dof01 para identificar los elementos regulatorios asociados con la respuesta a estrés por temperatura y obtener el promotor mínimo necesario para regular la transcripción.