Expresión diferencial de genes como respuesta a estrés salino en tomate de árbol (Solanum betaceum)

Resumen

El tomate de árbol (Solanum betaceum) es un cultivo frutal endémico de los Andes, producido principalmente en Colombia, Perú y Ecuador. Esta especie se ha adaptado a un rango amplio de condiciones agroecológicas y ha demostrado ser resistente a diferentes factores de marginalidad, incluyendo suelos salinos. Se presenta una exploración preliminar de los mecanismos genéticos que confieren tolerancia a la salinidad en S. betaceum. Se seleccionaron dos genotipos de S. betaceum que contrastan en su capacidad de tolerar alta salinidad in vitro. Se llevó a cabo un análisis de expresión diferencial para comparar los perfiles de expresión genética entre plantas expuestas a estrés salino y sin estrés (control) en ambos genotipos. Se identificaron 171 transcritos expresados diferencialmente (DETs); de estos, 30 mostraron homología con genes candidatos asociados a tolerancia a estrés salino en distintas especies. A éstos se les atribuyó roles putativos en respuesta a estrés, fotosíntesis, metabolismo celular y metabolismo de la pared celular. 22 DETs mostraron homología con proteínas sin función identificada. Estas secuencias identificadas abren posibilidades nuevas de investigación en busca de mecanismos que intervienen en la tolerancia al estrés salino en el tomate de árbol. A pesar de sus inherentes limitaciones, el análisis por despliegue diferencial permitió identificar y validar a través de RT-qPCR 3 DETs que se inducen en condiciones de estrés salino. El expandir nuestros análisis mediante la validación de DETs adicionales contribuiría a la identificación de genes que pueden usarse como base para un mejor entendimiento de los mecanismos regulatorios, metabólicos y fisiológicos usados por S. betaceum para responder a este tipo de estrés abiótico.