Caracterización, análisis in silico y expressión de genes DREB2 y VPasa de Suaeda edulis

Resumen

La salinidad del suelo afecta severamente a las plantas y en especial a las de importancia agrícola. Las halófitas son resistentes a estrés por salinidad ya que han desarrollado varios mecanismos génicos de resistencia, como es la compartimentación enzimática de Na+ en vacuolas mediante la pirofosfatasa vacuolar (VPasa) y la sobreexpresión de factores de transcripción como las proteínas de Unión a Elementos Sensibles a la Deshidratación (DREB; siglas en Inglés). Las halófitas son una fuente potencial de genes de resistencia a la salinidad y son consideradas como modelo de estudio ante este tipo de estrés. En este estudio, se utilizó el halófito Suaeda edulis para la identificación, caracterización, análisis in silico y expresión de los genes DREB y VPase. Las secuencias deducidas de aminoácidos de SeDREB y SeVP muestran una similitud mayor al 80% con sus homólogos y presentan los dominios y motivos conservados. La filogenia mostró que SeDREB pertenece al subgrupo A2 que se expresa por salinidad, mientras que SeVP está en el grupo de las K-dependientes. El análisis de coexpresión in silico muestra la interacción con varias proteínas relacionadas con la salinidad y la sequía. La expresión de los genes fue mayor en raíces y hojas en plantas silvestres que las crecidas in vitro. El análisis de suelo del hábitat de S. edulis mostró un pH de 9.2, un EC=4.2 dS m-1, así como un factor de translocación para sodio de 3.4, lo que indica una mayor adsorción de este metal por la planta.